Considerando la importancia del cultivo de cacao (Theobroma cacao L.) en Bolivia, es necesario tener documentado los recursos genéticos con las que cuenta la Región de Alto Beni-La Paz, que concentra cerca de 84% de la producción nacional. En el presente estudio se caracterizó morfológicamente 29 árboles promisorios en el área Ila (Sapecho). La cual se evaluó de acuerdo con variables cualitativas y cuantitativas, tolerancia a enfermedades e identificó selecciones sobresalientes en productividad. Los descriptores cualitativos presentaron en su mayoría un fruto de forma oblonga con ápice agudo y una constricción basal intermedia a suave, rugosidad intermedia con pares de carpelos fusionados, frutos relativamente grandes. La semilla fue de forma oblonga, color de cotiledón morado y violeta y espesor relativamente aplanada, las hojas mostraron una base redondeada y aguda, con ápice acuminado corto, color de brote rojo pálido con verde. La flor presentó antocianina de color suave en la lígula e intermedio en Pedúnculo, suave en sépalo, intenso en estaminodio, y ausente en el filamento. Las características cuantitativas y las medidas presentaron un CV menor al 20% en la gran mayoría de los descriptores, observándose una mayor variabilidad en fruto y semilla, con una media en longitud de fruto de 21.23 cm, ancho de fruto 8.73 cm, grosor de cascara 1,26 cm y 36 semillas por fruto en promedio. En relación a los ocho descriptores cuantitativos de fruto, seis contribuyeron en la diferenciación de grupos peso fresco (Kg), longitud de fruto (cm), ancho de fruto (cm), relación largo/ancho, grosor de endocarpio (mm), grosor de cascara (cm). Los descriptores de la semilla longitud, diámetro y peso fresco de semilla fueron los que diferencian entre individuos agrupados. Se destacó que las selecciones Ila-107, Ila-1 12, Ila-92,Ha-102, Ha-103 y Ha-22 no presentaron monialiasis arguyendo que son tolerantes a esta enfermedad. La selección SS-44 sobresalió en el componente del rendimiento en valor alto 7.4 kg/planta. La selección Ila-92 y Ila-103 demostró el mejor valor en relación al índice de pepa, 2 gr. Considerando que Ila-15 demostró el mayor valor en cuanto al índice de mazorca, siendo necesario 13 mazorcas para obtener 1Kg de pepa en peso seco.